Данный период описывает зарождение и развитие ПК на Востоке, в академической среде врачей постсоветского пространства. Данный период характеризуется развитием ПК на академическом уровне - под контролем врачей с высшим медицинским образованием начали производиться исследования в области ПК с целью обоснования таких феноменов как «функциональная мышечная слабость», «терапевтическая локализация» и т.д.
В 1990 году мануальный терапевт (на тот момент доцент) Саморуков А. Е. (ныне президент Московской ассоциации мануальной терапии, 02/2022) вместе с заведующим кафедрой неврологии Новокузнецкого ГИДУВА - профессором Коганом О. Г. и его сотрудниками посетили международную конференцию в Москве с участием американских хиропрактиков и представителей различных высших медицинских учебных заведений и научно-исследовательских институтов для выступления с докладами о новых направлениях в мануальной терапии. В ходе данной конференции российские врачи познакомились с методикой ПК во время презентации от специалиста из Дании - Дж. Шейфера (дипломант ICAK). Представленная методика настолько заинтересовала аудиторию, что спустя некоторое время (1991 год), по приглашению профессора О. Г. Когана в Новокузнецке (Россия) прошел первый учебный семинар по ПК от специалиста ICAK Дж. Шейфера. Обучение прошли как практикующие врачи, так и преподаватели вузов из России (проф. Шмидт И. Р. проф. Васильева Л. Ф., проф. Иваничев Г. А., Тимофеева Е. И., проф. Веселовский В. П., проф. Барвинченко А. Н., академик РАМН проф. Скоромец А. А., проф. Федин А. И., проф. Тимофеева М. И., проф. Кипервас И. П., доц. Кузнецова О.В, проф. Чеченин А. Г.), Белоруссии (проф. Филиппович Н. И.), Украины (доц. Кадырова Л. А.), Казахстана (проф. Красноярова Н. А.), Германии, Израиля и Прибалтики (Латвия, Литва, Эстония). Таким образом, c 1991 г. по настоящее время аналогичные семинары ежегодно проводятся в разных городах постсоветского пространства. Российские ученые-врачи внесли весомый вклад в научное обоснование феномена функциональной мышечной слабости. Была проведена огромная работа по внедрению ПК в учебные программы циклов усовершенствования врачей [b].
Так, на начальном этапе обучение ПК проводилось на кафедре мануальной терапии РГГУ (проф. Васильева Л. Ф.), на кафедре реабилитации Академии постдипломного образования (Санкт-Петербург), на кафедре неврологии, мануальной терапии и рефлексотерапии (зав кафедрой проф. Чеченин А. Г.) Новокузнецкого ГИДУВа, на кафедре мануальной терапии Владивостокского мединститута (зав. кафедрой мануальной терапии Беляев А. Ф.).
В 2000 г. зарегистрирована Межрегиональная ассоциация прикладной кинезиологии (МАПК), объединяющая более 200 врачей разной специальности. Ее организатором и бессменным президентом до 2010 гг. являлась проф. Васильева Л. Ф. В настоящее время (02/2022) президентом ассоциации является к. м.н. Субботин С. П. При ассоциации создана школа ПК для знакомства врачей разных специальностей с основами ПК. В том же году в Российском медицинском университете организован курс традиционной медицины (зав. курсом проф. Васильева Л. Ф.) при кафедре неврологии ФУВ (зав. кафедрой проф. Федин А. И.). В 2003 г. курс преобразован в самостоятельную кафедру мануальной терапии, занимающуюся разработкой и внедрением обучения ПК в рамках мануальной терапии (зав. кафедрой мануальной терапии проф. Васильева Л. Ф.).
В результате, в 2005 г. Минздравом РФ утверждена программа обучения по ПК «Мануальная терапия в восстановительном лечении». Также организована кафедра ПК (зав. кафедрой проф. Васильева Л. Ф.) при Российской академии медицинской реабилитации (ректор проф. Юнусов Ф. А.) и выпущены методические рекомендации по мануальной терапии «Мануальная терапия патобиомеконических изменений, возникших при спондилогенных заболеваниях», составленные группой авторов: Карпеев А. А., Ситель А. Б., Скоромец А. А., Гайденко В. С., Васильева Л. Ф., Саморуков А. Е., где в состав методов мануальной терапии, разрешенных к применению на территории России, входят: краниосакральная, вертебральная мануальная терапия и ПК [b].
Таким образом была организована отдельная кафедра, разработаны отдельные обучающие программы для врачей, была создана отдельная Ассоциация. Так сформировался второй «локомотив» международного масштаба - по развитию и популяризации ПК – Академия ПК профессора Васильевой.